MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Marinomonas mediterranea MMB-1 chromosome

Total Repeats: 88809

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015276	TAA	3	9	214	222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326793323
2	NC_015276	TGCT	2	8	246	253	0 %	50 %	25 %	25 %	326793323
3	NC_015276	CAA	2	6	318	323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326793323
4	NC_015276	CACCGC	2	12	327	338	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	326793323
5	NC_015276	CAC	2	6	339	344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326793323
6	NC_015276	AGTGGA	2	12	556	567	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	326793323
7	NC_015276	GGT	2	6	569	574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326793323
8	NC_015276	AAT	2	6	596	601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326793323
9	NC_015276	TA	3	6	706	711	50 %	50 %	0 %	0 %	326793323
10	NC_015276	GGC	2	6	713	718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326793323
11	NC_015276	GTG	2	6	791	796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326793323
12	NC_015276	TTA	2	6	871	876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326793323
13	NC_015276	GAT	2	6	902	907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326793323
14	NC_015276	T	6	6	914	919	0 %	100 %	0 %	0 %	326793323
15	NC_015276	AAG	2	6	939	944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326793323
16	NC_015276	TTA	2	6	968	973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326793323
17	NC_015276	GGT	2	6	977	982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326793323
18	NC_015276	TTGG	2	8	1056	1063	0 %	50 %	50 %	0 %	326793323
19	NC_015276	GCC	2	6	1084	1089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326793323
20	NC_015276	AGA	2	6	1129	1134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326793323
21	NC_015276	CTTT	2	8	1164	1171	0 %	75 %	0 %	25 %	326793323
22	NC_015276	CG	3	6	1253	1258	0 %	0 %	50 %	50 %	326793323
23	NC_015276	AG	3	6	1277	1282	50 %	0 %	50 %	0 %	326793323
24	NC_015276	ATA	2	6	1329	1334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326793323
25	NC_015276	TTG	2	6	1344	1349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	326793323
26	NC_015276	TAT	2	6	1355	1360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326793323
27	NC_015276	ACG	2	6	1502	1507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326793323
28	NC_015276	ACAA	2	8	1572	1579	75 %	0 %	0 %	25 %	326793323
29	NC_015276	ACC	2	6	1595	1600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326793323
30	NC_015276	GTC	2	6	1648	1653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326793324
31	NC_015276	CGT	2	6	1692	1697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326793324
32	NC_015276	TGA	2	6	1812	1817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326793324
33	NC_015276	AAG	2	6	1823	1828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326793324
34	NC_015276	TGG	2	6	1856	1861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326793324
35	NC_015276	TGA	2	6	1908	1913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326793324
36	NC_015276	CAT	2	6	1923	1928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326793324
37	NC_015276	TGCC	2	8	1964	1971	0 %	25 %	25 %	50 %	326793324
38	NC_015276	ATCG	2	8	2047	2054	25 %	25 %	25 %	25 %	326793324
39	NC_015276	TAC	2	6	2089	2094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326793324
40	NC_015276	TGT	2	6	2105	2110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	326793324
41	NC_015276	GTT	2	6	2137	2142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	326793324
42	NC_015276	GCG	2	6	2192	2197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326793324
43	NC_015276	TTG	2	6	2248	2253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	326793324
44	NC_015276	TGA	2	6	2313	2318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326793324
45	NC_015276	AAT	2	6	2383	2388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326793324
46	NC_015276	A	6	6	2390	2395	100 %	0 %	0 %	0 %	326793324
47	NC_015276	CG	3	6	2437	2442	0 %	0 %	50 %	50 %	326793324
48	NC_015276	TTCT	2	8	2447	2454	0 %	75 %	0 %	25 %	326793324
49	NC_015276	AAC	2	6	2515	2520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326793324
50	NC_015276	GAA	2	6	2530	2535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326793324
51	NC_015276	GTT	2	6	2620	2625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	326793324
52	NC_015276	AAG	2	6	2633	2638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326793324
53	NC_015276	CAG	2	6	2664	2669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326793324
54	NC_015276	GAA	2	6	2680	2685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326793324
55	NC_015276	GCA	2	6	2698	2703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326793324
56	NC_015276	CGT	2	6	2709	2714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326793324
57	NC_015276	AC	3	6	2761	2766	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_015276	CGTG	2	8	3075	3082	0 %	25 %	50 %	25 %	326793325
59	NC_015276	ATT	2	6	3162	3167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326793325
60	NC_015276	GA	3	6	3246	3251	50 %	0 %	50 %	0 %	326793325
61	NC_015276	GCTT	2	8	3281	3288	0 %	50 %	25 %	25 %	326793325
62	NC_015276	GCT	2	6	3319	3324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326793325
63	NC_015276	TGG	2	6	3348	3353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326793325
64	NC_015276	AC	3	6	3533	3538	50 %	0 %	0 %	50 %	326793325
65	NC_015276	TGG	2	6	3623	3628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326793325
66	NC_015276	GTCTG	2	10	3811	3820	0 %	40 %	40 %	20 %	326793325
67	NC_015276	CCGT	2	8	3942	3949	0 %	25 %	25 %	50 %	326793326
68	NC_015276	GTAT	2	8	3960	3967	25 %	50 %	25 %	0 %	326793326
69	NC_015276	GAC	2	6	3980	3985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326793326
70	NC_015276	CAC	2	6	3998	4003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326793326
71	NC_015276	GTC	2	6	4016	4021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326793326
72	NC_015276	GTCTGT	2	12	4090	4101	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	326793326
73	NC_015276	GAA	3	9	4139	4147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326793326
74	NC_015276	CTG	2	6	4155	4160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326793326
75	NC_015276	TGG	2	6	4189	4194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326793326
76	NC_015276	TGA	2	6	4201	4206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326793326
77	NC_015276	TGG	2	6	4225	4230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326793326
78	NC_015276	CAT	2	6	4354	4359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326793326
79	NC_015276	TTTA	2	8	4426	4433	25 %	75 %	0 %	0 %	326793326
80	NC_015276	TCTT	2	8	4469	4476	0 %	75 %	0 %	25 %	326793326
81	NC_015276	GAA	2	6	4523	4528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326793326
82	NC_015276	TTC	2	6	4529	4534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326793326
83	NC_015276	CGA	2	6	4624	4629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326793326
84	NC_015276	AGA	2	6	4633	4638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326793326
85	NC_015276	CAA	2	6	4705	4710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326793326
86	NC_015276	CGG	2	6	4726	4731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326793326
87	NC_015276	CACT	2	8	4732	4739	25 %	25 %	0 %	50 %	326793326
88	NC_015276	GTG	2	6	4752	4757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326793326
89	NC_015276	TAA	2	6	4774	4779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326793326
90	NC_015276	GAA	2	6	4804	4809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326793326
91	NC_015276	CAA	2	6	4821	4826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326793326
92	NC_015276	TGA	2	6	4831	4836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326793326
93	NC_015276	TTCTC	2	10	4889	4898	0 %	60 %	0 %	40 %	326793326
94	NC_015276	TCT	2	6	4919	4924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326793326
95	NC_015276	ATC	2	6	5003	5008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326793326
96	NC_015276	GAT	2	6	5017	5022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326793326
97	NC_015276	TGC	2	6	5026	5031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326793326
98	NC_015276	TCG	2	6	5050	5055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326793326
99	NC_015276	GGT	2	6	5180	5185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326793326
100	NC_015276	CGT	2	6	5207	5212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326793326
101	NC_015276	TTC	3	9	5432	5440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326793326
102	NC_015276	CGT	2	6	5510	5515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326793326
103	NC_015276	GAAC	2	8	5518	5525	50 %	0 %	25 %	25 %	326793326
104	NC_015276	AGC	2	6	5553	5558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326793326
105	NC_015276	AAG	2	6	5667	5672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326793326
106	NC_015276	GT	3	6	5691	5696	0 %	50 %	50 %	0 %	326793326
107	NC_015276	ACT	2	6	5788	5793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326793326
108	NC_015276	TGT	2	6	5881	5886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	326793326
109	NC_015276	CAT	2	6	5890	5895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326793326
110	NC_015276	AAC	2	6	5909	5914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326793326
111	NC_015276	CTT	2	6	5935	5940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326793326
112	NC_015276	GTT	2	6	5992	5997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	326793326
113	NC_015276	GTG	2	6	6021	6026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326793326
114	NC_015276	CA	3	6	6031	6036	50 %	0 %	0 %	50 %	326793326
115	NC_015276	TGA	2	6	6057	6062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326793326
116	NC_015276	TGA	2	6	6072	6077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326793326
117	NC_015276	AAG	2	6	6078	6083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326793326
118	NC_015276	GA	3	6	6123	6128	50 %	0 %	50 %	0 %	326793326
119	NC_015276	TCG	2	6	6172	6177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326793326
120	NC_015276	TGA	2	6	6196	6201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326793326
121	NC_015276	CGA	2	6	6241	6246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326793326
122	NC_015276	CGT	2	6	6257	6262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326793326
123	NC_015276	TAAT	2	8	6308	6315	50 %	50 %	0 %	0 %	326793326
124	NC_015276	T	6	6	6369	6374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015276	GCT	2	6	6447	6452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326793327
126	NC_015276	GCG	2	6	6564	6569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326793327
127	NC_015276	TTC	2	6	6611	6616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326793327
128	NC_015276	GCT	3	9	6753	6761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326793327
129	NC_015276	TAG	2	6	6974	6979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326793327
130	NC_015276	CTT	2	6	7009	7014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326793327
131	NC_015276	TGC	2	6	7016	7021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326793327
132	NC_015276	TGA	2	6	7024	7029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326793327
133	NC_015276	AGA	2	6	7067	7072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326793327
134	NC_015276	AAC	2	6	7079	7084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326793327
135	NC_015276	GTC	2	6	7107	7112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326793327
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250	NC_015276	GACT	2	8	13048	13055	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
251	NC_015276	AGA	2	6	13105	13110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326793334
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256	NC_015276	AGA	2	6	13404	13409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326793334
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262	NC_015276	TCA	2	6	13554	13559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326793334
263	NC_015276	TTGT	2	8	13560	13567	0 %	75 %	25 %	0 %	326793334
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265	NC_015276	AAT	2	6	13700	13705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326793334
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398	NC_015276	TGAT	2	8	20875	20882	25 %	50 %	25 %	0 %	326793340
399	NC_015276	CAA	2	6	20914	20919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326793340
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401	NC_015276	TTGA	2	8	21111	21118	25 %	50 %	25 %	0 %	326793340
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416	NC_015276	TTA	2	6	21507	21512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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488	NC_015276	GC	3	6	26535	26540	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
489	NC_015276	TA	3	6	26543	26548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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492	NC_015276	TCT	2	6	26676	26681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
493	NC_015276	CAT	2	6	26750	26755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
494	NC_015276	TTTC	2	8	26765	26772	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
495	NC_015276	AT	3	6	26809	26814	50 %	50 %	0 %	0 %	326793347
496	NC_015276	AGA	3	9	26912	26920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326793347
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